第58章 论文打假 重生2008:从助教逆袭为院士
关於这个问题,吴辰早已经有了想法。
“你有没有想过,为什么已经过去这么久,aβ*56还是只能由西尔万的实验室合成,以至於1克样本就要300万美元?”
“难度太大了。”
姜楠说。
aβ*56是一个病变蛋白,只存在於阿尔兹海默症患者体內,提取过程非常繁琐,並且成功率很低。
与其花费巨大风险去提取,还不如直接购买样品。
“所以这就是医药类论文是造假重灾区的一个重要原因啊。”
吴辰说。
听到他的调侃,姜楠忍不住又是一个白眼,但却没有反驳。
不过她也懒的再问了,反正吴辰说不出一周就会有结果。
这一点上,她还是相信对方的。
到家后,姜楠一进门,就发现父母正坐在客厅里等自己。
看著他们八卦的眼神,她忍不住一阵扶额。
-----------------
在姜楠努力陈述自己还不想恋爱,两人只是同事关係时,吴辰已经到家了。
简单洗漱了一下,又把吴淑芬餵饱,他便打开电脑,找到了那篇著名的论文:
《a specific amyloid-β assembly in the brain impairs memory》。
中文名是《大脑中一种特定的β淀粉样蛋白组装体损害记忆》,第一作者西尔万。
通读了一遍论文后,吴辰果然发现了几个问题。
首先是图1中,aβ*56的蛋白电泳条带图有造假痕跡。
不过让他一点一点的去抠图分析,那是不可能的。
这没有一两个星期是做不下来的,他不会在这件事情上浪费这么久。
所以他选择用图像分析的方法来做,这样就能非常轻易的检查出图像的拼接问题。
於是他基於opencv,快速编写了一个图像特徵分析算法,来计算每条条带的灰度分布和背景噪点的標准差。
如果图像涉嫌造假,那么这两个值的差异会非常大。
(请记住 读小说上 101 看书网,????????????.??????超讚 网站,观看最快的章节更新)
除此之外,为了更具有信服力,他又单独用canny算子检测了条带边缘。
如果是拼接的图片,那么边缘肯定会有像素级的断裂痕跡,与正常条带的连续边缘差別很大,也可以作为实锤证据之一。
除了对图像本身分析外,还需要对实验数据进行处理。
吴辰先將论文中实验小鼠的逃避潜伏期(escape latency)提取出来,然后计算了它的变异係数cv。
其中,逃避潜伏期是指生物实验时,实验动物从进入水迷宫,到成功爬上隱藏平台所需的时间。
正常小白鼠的时间,肯定要比注射了aβ*56蛋白的时间要短。
將两个算法在启明一號上运行起来后,吴辰觉得有点饿,就去给自己煮了一包泡麵。
15分钟后,数据结果刚好出来。
当然这是基於他opencl架构的电脑,如果是其他人的电脑,是不可能这么快计算出结果的,时间至少要多十几倍。
检查一番后,吴辰发现计算结果果然如自己所料,存在大量的造假痕跡。
第一张图经过扫描后,一眼就可以看出aβ*56条带的背景噪点,和其他条带完全不是一个画风。
很明显就是拼接上去的。
而实验数据就更离谱了。
论文中正常小白鼠的cv仅为3%,远低於標准值15%,数值极不合理。
就像一场满分100的期末考试,班级的平均分竟然是95。
这种方差的离散值,在常理计算中是不可能的。
有这两份数据,基本就可以实锤西尔万的这篇论文造假了。
但吴辰並不满足於此。
因为这篇论文的问题,实际上在业內已经有过討论了。
最主要的一个问题,就是有多个实验室在尝试合成aβ*56时,都以失败告终。
但这篇文章是发表在《自然》上的,而且西尔万的老师还是在阿尔兹海默症研究领域內的大牛卡伦.阿什,所以大家更多的时候都在怀疑自己。
本章未完,点击下一页继续阅读。(1 / 2)