第58章 论文打假 重生2008:从助教逆袭为院士
或者说,就算这篇论文中的数据有问题,那也没法证明aβ*56是无效的。
因为阿尔兹海默症患者体內的β淀粉样蛋白確实產生了病变。
问题的核心,在於到底是aβ*56引起了阿尔兹海默症,还是阿尔兹海默症引发了aβ*56蛋白的產生。
要证明这个问题,就像是辩证先有鸡还是先有蛋一样。
但吴辰也有自己的解决方案,那就是用支持向量机svm和rosetta(一个用於蛋白质结构建模的软体),来预测aβ*56的特性。
因为他记得一个关键点,就是后世已经证明,aβ*56蛋白极不稳定,其特性根本不可能导致阿尔兹海默症。
有了思路后,吴辰从系统提供的全量医药资料库中,找出了10万条已知稳定性的蛋白序列,然后將序列特徵中的疏水指数、胺基酸电荷和二级结构作为算法的输入特徵,来训练svm模型。
预测的结果,就是aβ*56热稳定性。
除此之外,还需要用rosetta来预测 aβ*56的三维结构。
不过这一次的计算量,就不是几张图片解析那么容易了。
初步预估的计算时间在两天以上。
確认算法运行稳定后,吴辰便將它丟在一边,开始了今日份的学习。
“系统,启动深度阅读状態!”
【深度阅读状態已开启】
今天吴辰选择的论文都是关於doc2vec(段落向量,与word2vec相比更进一步,类似段落和单字的区別)的。
因为在下周六去京大讲座时,他想和百度知识部门的人討论数据获取的事情。
如果word2vec打动不了他们的话,那么doc2vec他们肯定会心动的。
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接下来的几天,日子就这样平稳的过去。
算法运行中途出现一次参数偏差,不过经过调整后很快就解决了。
最终吴辰在周四的晚上得到了想要的结果。
数据清晰的显示,aβ*56的热力学稳定性极差。
满分10分的標准,它仅仅达到了1.2的分数。
同时它的生理环境半衰期还小於三个半小时,过后便会分解为没有独立生物活性的aβ42二聚体。
所以最终的结论很明显。
aβ*56蛋白,根本就无法作为阿尔兹海默症药物靶点。
吴辰將分析报告整理一番后,发送到了姜楠的邮箱。
他相信她会理解的。
看了看时间,已经是凌晨一点多,该睡觉了。
说好的再不熬夜,结果每次都因为这样或那样的事情耽误。
他將手机静音,然后给床头的机械闹钟设定了早上六点后,就立即陷入了沉眠。
但他不知道的是,半小时后,他的手机几乎被打爆。
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“楠楠,还是打不通电话吗?”
江东药厂的实验室里,姜鸿约、来淑嫻以及一大群实验人员竟然都在。
虽然已经快凌晨两点,但此刻根本没有一个人有睡意。
所有人都红著眼睛盯著姜楠看。
“打不通。”
姜楠嗓音沙哑的回答。
“这……”
姜鸿约也很焦躁。
明天他就要和赛默飞公司签购买aβ*56样本的合同了。
结果刚刚姜楠收到吴辰的邮件,说这是一个骗局?
就在眾人一筹莫展之际,姜楠突然將手机揣进兜里。
“我去他家找他。”
说罢,她不顾眾人诧异的目光,连白大褂也来不及脱,就大步走出了实验室。